Si, segun la ecuacion de continuidad el producto de velocidad por sección permanece constante, supongo que cuando aumente una disminuirá la otra y viceversa.
Un ejemplo muy sencillo, la sección de la aorta es de 3 cm cuadrados si no me equivoco y su velocidad no la recuerdo muy bien en terminos numericos, pero digamos rápida (un poco cutre, lo sé) ahora bien, en la zona de los capilares la sección se aproximaría a 800 veces la sección de la aorta y la velocidad es cercana a 1cm cada segundo, de forma que haya tiempo para que tenga lugar el intercambio de nutrientes y gases, vamos, lo que ya sabrás.
Espero haberme explicado.